Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

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Length 1,331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP2Q9UHC6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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