Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TBCCD1Q9NVR7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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