Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms