Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms