Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C2orf88Q9BSF0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms