Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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UBXN4Q92575 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
UBXN4Q92575 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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UBXN4Q92575 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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UBXN4Q92575 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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UBXN4Q92575 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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