Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HDDC3Q8N4P3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HDDC3Q8N4P3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HDDC3Q8N4P3 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDDC3Q8N4P3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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