Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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TRAPPC6BQ86SZ2 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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TRAPPC6BQ86SZ2 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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TRAPPC6BQ86SZ2 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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TRAPPC6BQ86SZ2 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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TRAPPC6BQ86SZ2 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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TRAPPC6BQ86SZ2 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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