Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms