Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SMARCD3Q6STE5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SMARCD3Q6STE5 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SMARCD3Q6STE5 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SMARCD3Q6STE5 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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