Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFWD3Q6PCD5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFWD3Q6PCD5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFWD3Q6PCD5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFWD3Q6PCD5 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFWD3Q6PCD5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFWD3Q6PCD5 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms