Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms