Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms