Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALFQ53S48 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALFQ53S48 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms