Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDCCQ504Y2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms