Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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