Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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