Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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