Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms