Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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RPE65Q16518 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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RPE65Q16518 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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RPE65Q16518 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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RPE65Q16518 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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