Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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