Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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