Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAM2Q15035 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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