Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms