Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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GBX1Q14549 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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GBX1Q14549 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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GBX1Q14549 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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GBX1Q14549 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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GBX1Q14549 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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GBX1Q14549 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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GBX1Q14549 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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GBX1Q14549 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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GBX1Q14549 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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