Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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