Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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