Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPRL3Q12980 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms