Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTP4A2Q12974 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTP4A2Q12974 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTP4A2Q12974 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTP4A2Q12974 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTP4A2Q12974 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTP4A2Q12974 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTP4A2Q12974 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTP4A2Q12974 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PTP4A2Q12974 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PTP4A2Q12974 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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