Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP1B1Q10567 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms