Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms