Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms