Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FMODQ06828 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FMODQ06828 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FMODQ06828 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FMODQ06828 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FMODQ06828 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FMODQ06828 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FMODQ06828 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FMODQ06828 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FMODQ06828 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FMODQ06828 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FMODQ06828 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FMODQ06828 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FMODQ06828 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FMODQ06828 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FMODQ06828 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FMODQ06828 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms