Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU5F1Q01860 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms