Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms