Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXC5Q00444 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms