Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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EFNB1P98172 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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EFNB1P98172 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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EFNB1P98172 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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EFNB1P98172 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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EFNB1P98172 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
EFNB1P98172 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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EFNB1P98172 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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EFNB1P98172 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EFNB1P98172 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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