Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms