Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COG7P83436 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COG7P83436 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG7P83436 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG7P83436 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG7P83436 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG7P83436 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG7P83436 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COG7P83436 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG7P83436 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG7P83436 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG7P83436 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COG7P83436 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms