Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms