Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ERVFC1-1P60608 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms