Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HADHBP55084 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HADHBP55084 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HADHBP55084 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HADHBP55084 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HADHBP55084 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HADHBP55084 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HADHBP55084 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms