Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLMP48507 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLMP48507 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLMP48507 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLMP48507 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLMP48507 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLMP48507 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLMP48507 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLMP48507 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLMP48507 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLMP48507 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLMP48507 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLMP48507 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms