Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms