Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PSMB10P40306 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms