Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5C1P36542 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms