Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms