Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF2H1P32780 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H1P32780 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms