Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms