Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GJB2P29033 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GJB2P29033 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GJB2P29033 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms